1973年：9月26日，经中国人民解放军兰字930部队后勤部党委批复，成立兰州军区生产建设兵团林业建设师医院党支部。

1973年：10月，位于东大街炮台巷的兰州军区生产建设兵团林业建设师医院基本竣工。

1975年：原兰州军区生产建设兵团林业建设师医院移交地方，定名为庆阳地区第三人民医院，归庆阳地区卫校管理。

1976年：9月22日，地区卫生学校与地区第三人民医院分设。

1979年：5月9日，庆阳地区第三人民医院改建为庆阳地区中医医院。

1980年：4月16日，成立中国共产党庆阳地区中医医院委员会。

1981年：7月13日，经地区卫生局批复，增设床位20张，床位总数达到120张。

1983年：12月17日，经地委编委批复，医院设办公室、护理部、门诊部、医务科、总务科、财务科、药剂科、放射科、检验科、内科、小儿科、外妇科。

1984年：10月，医院召开了首届党员（代表）大会。

1986年：7月16日，医院召开了首届职工代表大会。

1988年：12月，位于东大街门诊大楼竣工。

1991年：10月，被国家中医药管理局确定为全国首批地（市）级示范中医医院建设单位。

1995年：9月，医院通过了“二级甲等”中医医院初评验收。

1996年：12月26日，经国家中医药管理局批准，为“全国示范中医医院”。

2001年：5月16日，经省卫生厅组织专家评审验收，确定血液病科为甘肃省首批重点中医药专科。

2003年：9月25日，中医药制剂实验室、血液病实验室为甘肃省中医药科研一级实验室。

2008年：8月22日，经省卫生厅组织专家评审，授予庆阳市中医医院“三级乙等”中医医院称号。

2009年：10月，选址于庆阳市西峰区长庆北路与古象西路交汇处东南角的新院开工建设。

2010年：8月26日，面向社会公开征集，评选确定了院训、院徽、院旗、院歌。

2012年：8月1日，举行整体搬迁落成典礼。

2013年：7月26日，举行了“三级甲等”中医医院揭牌仪式。

2016年：3月18日，庆阳市名医堂正式设立，开设专家诊室17间。

2016年11月11日，经甘肃省中医药管理局批复，核增床位200张，床位总数达到900张。

2017年：8月24日，医院被甘肃省卫计委命名为“甘肃省健康促进医院”。

2018年：12月28日，医院被确定为第二批住院医师规范化培训基地。

2019年：12月5日，医院被遴选确定为建立健全现代医院管理制度试点医院。

2021年：2月1日，省卫健委印发文件，医院通过“三级甲等”中医医院复审。

2022年：4月21日，市政府与甘肃中医药大学签订了合作共建甘肃中医药大学第五附属医院的框架协议。

2023年：医院喜迎50周岁华诞。